Fin 1944. Le Japon est en train de perdre la guerre. Sur ordre du mystérieux Major Taniguchi, le jeune Hiroo Onoda est envoyé sur une île des Philippines juste avant le débarquement américain...
Au XVIIe siècle, deux jeunes missionnaires portugais se rendent au Japon pour retrouver
leur mentor disparu alors qu’il tentait de répandre les enseignements du christianisme...