Dans la saison trois, Bumpy Johnson continue de se battre pour le contrôle de Harlem face aux efforts d'autres aspirants au trône, notamment de la mafia cubaine du quartier voisin. En s'attaquant à la mafia cubaine, Bumpy, ses proches et sa communauté se retrouvent la cible de leurs rivaux italiens, mais aussi d'impitoyables assassins latinos et, pour finir, de la CIA. « Godfather of Harlem » dépeint les liens et les conflits entre le monde de la pègre et le mouvement pour les droits civiques pendant l'une des périodes les plus agitées de l'histoire des États-Unis.