En vacances sur un bateau de croisière, Alvin, Simon, Théodore et les Chipettes font les 400 coups. Lorsqu'ils échouent sur une îles déserte, ils profitent de ce décor paradisiaque pour faire ce qu'ils connaissent le mieux, et ce qui les a propulsés au rang de stars : chanter et danser ! Mais ils ne tarderont pas à rencontrer une autre désespérément de les retrouver, les Chipmunks vont vivre leur plus grande aventure, où leurs instincts de survie seront mis à rude épreuve.